Es decir que existe la posibilidad que una partida de mercadería que en la recepción sea considerada libre de insectos, en realidad esté infestada (infestación oculta), incorporando a la planta de acopio una fuente de reinfestación. En este grupo se incluyen al gorgojo del trigo (Sitophilus granarius), al gorgojo del arroz (Sitophilus oryzae), al gorgojo del maíz (Sitophilus zeamais), al taladrillo de los cereales (Rhizopertha dominica) y a la palomita de los cereales (Sitotroga cerealella), entre las más importantes. Las larvas de este tipo de plaga se alimentan del interior del grano y abren las puertas para el ataque de las plagas de infestación secundaria. Estas últimas necesitan para su desarrollo que el grano almacenado esté dañado, ya sea por un insecto de infestación primaria o debido a condiciones de cosecha, manipuleo y acondicionamiento. Dentro de este grupo incluimos a la carcoma dentada (Oryzaephilus surinamensis), al tribolio castaño (Tribolium castancum), al tribolio confuso (Tribolium confusum), a la carcoma achatada (Cryptolestes pusillus), a la polilla de la harina (Ephestia kuehniella), y al piojo de los cereales (Liposcelis divinatorius), entre otras.

Los daños producidos por las mismas pueden ser directos o indirectos. Los directos son: pérdida de peso, reducción del poder germinativo, reducción del valor nutritivo, presencia de insectos, partes de ellos, huevos, pupas, heces, etc. Los indirectos son calentamiento y migración de humedad de los granos, reservorio de enfermedades, distribución de hongos, microorganismos y tratamiento con insecticidas.